​Os riscos são aqueles relacionados a qualquer procedimento cirúrgico. O estado de saúde do paciente antes da cirurgia é o principal determinante dos riscos e uma rigorosa avaliação pré-operatória é realizada para que se diminuam os riscos ao máximo. 

Ao se pesar os riscos da cirurgia deve-se ter em mente que quando se opta por não tratar a obesidade está se decidindo a enfrentar riscos muito maiores que os da cirurgia, ou seja, aqueles relacionados ao excesso de peso. Muitos pacientes, por medo ou incerteza, adiam a tomada de decisão com relação à cirurgia e acabam optando por serem operados em um momento no qual o excesso de peso já contribui no desenvolvimento de doenças que aumentam o risco da cirurgia.